V roce 1946 se přistěhovalo na Kaplicko několik rodin Slováků ze Slovenska a Čechů z Rumunska. Přišli sem, protože dostali do vlastnictví statky po odsunutých Němcích. Bohužel byly většině jejich statky po několika letech znárodněny a proto se někteří vrátili zpět na Slovensko.
Tito přistěhovalci založili (nebo obnovili?) evangelický farní sbor v Kaplici a začali se scházet v pronajaté místnosti. Ke kaplickému sboru patřily i kazatelské stanice Trhové Sviny, Český Krumlov a Velešín. V 50. letech zakoupili za 7.000 Kčs sborovou budovu, ve které jsme se scházeli do roku 2003. V roce 1962 zakoupil pro sbor pan Josef Botko harmonium.
Od roku 1946 do roku 1964 se na místě kaplického faráře vystřídali tito bratři: Šimek, Řehák, Strupl, Růžička, Pechar, Dus. Po odchodu posledního faráře v roce 1964 došlo vlivem totalitního režimu (viz. podobnost s dějinami církve: odvody na vojnu, ztráta zaměstnání, nemožnost studovat) ke snížení počtu členů. Ze samostatného sboru se stala kazatelská stanice sboru českobudějovického. Po určitý čas se ještě vyučovalo náboženství, avšak i to ustalo.
Na konci 70. let se bohoslužby v Kaplici konaly už jen jednou za měsíc. Pravidelně se jich účastnilo maximálně 5 evangelíků. K oživení došlo, když se do Kaplice v roce 1979 přistěhovala mladá rodina. Bohoslužby se začaly konat nejprve jednou za čtrnáct dní, poté třikrát za měsíc. Od roku 1993 se zde scházejí evangelíci každou neděli.
Po pádu totalitního systému se otevřely nové možnosti, takže bylo možno mluvit o Ježíši Kristu i veřejně. Do jižních Čech vstoupila skupina misionářů z organizace Operace Mobilizace. Navštěvovali místní školy a působili v Kaplici celý týden. Byli cizinci, což tehdy působilo atraktivně. Vlivem jejich činnosti se rozrostl počet členů. Jedna misionářka (Chung Nam You z Koreje) se do Kaplice nastěhovala a pokračovala v započatém díle. Setkávala se s novými lidmi a pokoušela se je oslovit. Docházelo k propojení misijní činnosti (jako prvního impulsu) se soustředěným vysvětlováním základů křesťanství. Objevili se první konfirmandi - někteří z řad příchozích, jiní z tradičního prostředí. V roce 1990 se vytvořila skupinka mládeže, která se z původních 5 členů rozrostla na 10.
V listopadu 1998 koupil českobudějovický sbor v Kaplici byt. Na druhé farářské místo byla povolána Ruth Kaštánková (od 1.4.2000 provdaná Brichová). V dubnu 1999 ukončila po 5 letech Chung Nam svoji činnost v Kaplici a odešla do Písku.
Od ledna 2003 se scházíme ve sboru Československé církve husitské v Kaplici. Budova sboru v ulici Na Bělidle byla prodána.